- s -

• SaveUniqueRing() : OBRingSearch
• Seed() : OBRandom
• SelectRootAtoms() : OBAromaticTyper
• Set() : vector3 , matrix3x3 , vector3 , OBBond , OBRotor
• SetAngle() : OBTorsion , OBAngle
• SetAntiClockwiseStereo() : OBAtom
• SetAromatic() : OBNodeBase , OBAtom , OBBond
• SetAromaticCorrected() : OBMol
• SetAromaticPerceived() : OBMol
• SetAtom() : OBExternalBond
• SetAtom4Refs() : OBChiralData
• SetAtomicNum() : OBAtom
• SetAtomID() : OBResidue
• SetAtoms() : OBAngle
• SetAtomTypesPerceived() : OBMol
• SetAttribute() : OBGenericData
• SetAutomaticFormalCharge() : OBMol
• SetAutomaticPartialCharge() : OBMol
• SetAuxConv() : OBConversion
• SetBaseCoordinateSets() : OBRotamerList
• SetBegin() : OBBond
• SetBgn() : OBEdgeBase
• SetBit() : OBFingerprint
• SetBitOff() : OBBitVec
• SetBitOn() : OBBitVec
• SetBO() : OBBond
• SetBond() : OBRotor , OBExternalBond
• SetChain() : OBResidue
• SetChainNum() : OBResidue
• SetChainsPerceived() : OBMol
• SetChiral() : OBAtom
• SetChiralityPerceived() : OBMol
• SetClockwiseStereo() : OBAtom
• SetClosure() : OBEdgeBase , OBBond
• SetClosureBondsPerceived() : OBMol
• SetColumn() : matrix3x3
• SetConformer() : OBMol
• SetConformers() : OBMol
• SetCoordPtr() : OBAtom
• SetCorrectedForPH() : OBMol
• SetData() : OBMol , OBRingData , OBUnitCell , OBResidue , OBConformerData , OBSymmetryData , OBTorsion , OBTorsionData , OBCommentData , OBAngleData , OBAtom , OBSerialNums , OBExternalBondData , OBBond
• SetDelta() : OBRotorRule , OBRotor
• SetDihedralAtoms() : OBRotor
• SetDimension() : OBMol , OBConformerData
• SetDisplacements() : OBConformerData
• SetDown() : OBBond
• SetEnd() : OBEdgeBase , OBBond , OBEdgeBase
• SetEnergies() : OBConformerData
• SetEnergy() : OBMol
• SetEnvironmentVariable() : OBGlobalDataBase
• SetEvalAtoms() : OBRotor , OBRotorList
• SetFilename() : OBRotorRules
• SetFixAtoms() : OBRotorList
• SetFixedAtoms() : OBRotor
• SetFlag() : OBAtom , OBBond , OBMol
• SetFlags() : OBMol
• SetForces() : OBConformerData
• SetFormalCharge() : OBAtom
• SetFormula() : OBMol
• SetFromType() : OBTypeTable
• SetGridType() : OBProxGrid
• SetHash() : OBBond
• SetHetAtom() : OBResidue
• SetHyb() : OBAtom
• SetHybAndGeom() : OBAtom
• SetHybridizationPerceived() : OBMol
• SetHydrogensAdded() : OBMol
• SetIdx() : OBNodeBase , OBResidue , OBAtom , OBBond , OBExternalBond , OBEdgeBase , OBRotor
• SetImplicitValence() : OBAtom
• SetImplicitValencePerceived() : OBMol
• SetInAndOutFormats() : OBConversion
• SetInFormat() : OBConversion
• SetInRing() : OBAtom , OBBond
• SetInStream() : OBConversion
• SetInternalCoord() : OBMol
• SetIsotope() : OBAtom
• SetKDouble() : OBBond
• SetKekulePerceived() : OBMol
• SetKSingle() : OBBond
• SetKTriple() : OBBond
• SetLength() : OBBond
• SetMatch() : OBNodeBase
• SetMaxLogEntries() : OBMessageHandler
• SetMoreFilesToCome() : OBConversion
• SetName() : OBResidue
• SetNegativeStereo() : OBAtom
• SetNum() : OBResidue
• SetNumCoords() : OBRotor
• SetOffset() : OBUnitCell
• SetOneObjectOnly() : OBConversion
• SetOptions() : OBConversion
• SetOutFormat() : OBConversion
• SetOutputIndex() : OBConversion
• SetOutputLevel() : OBMessageHandler
• SetOutputStream() : OBMessageHandler
• SetOutStream() : OBConversion
• SetParent() : OBNodeBase , OBEdgeBase , OBRing , OBNodeBase , OBEdgeBase
• SetPartialCharge() : OBAtom
• SetPartialChargesPerceived() : OBMol
• SetPointGroup() : OBSymmetryData
• SetPositiveStereo() : OBAtom
• SetQuiet() : OBRotorList
• SetRangeOff() : OBBitVec
• SetRangeOn() : OBBitVec
• SetReadDirectory() : OBGlobalDataBase
• SetResidue() : OBAtom
• SetResName() : OBResidueData
• SetRingAtomsAndBondsPerceived() : OBMol
• SetRotAtoms() : OBRotorList , OBRotor
• SetRotAtomsByFix() : OBRotorList
• SetRotor() : OBRotor
• SetRow() : matrix3x3
• SetSerialNum() : OBResidue
• SetSpaceGroup() : OBSymmetryData , OBUnitCell
• SetSpinMultiplicity() : OBAtom
• SetSpinMultiplicityAssigned() : OBMol
• SetSSSRPerceived() : OBMol
• SetStartAndEnd() : OBConversion
• SetTitle() : OBMol
• SetToAngle() : OBRotor
• SetTorsion() : OBMol
• SetTorsionValues() : OBRotor
• SetTotalCharge() : OBMol
• SetTotalSpinMultiplicity() : OBMol
• SetToType() : OBTypeTable
• SetType() : OBAtom , OBScoreGrid
• Setup() : OBRotamerList
• SetUp() : OBBond
• Setup() : OBScoreGrid , OBProxGrid , OBRotamerList , OBProxGrid , OBScoreGrid , OBRotorList
• SetupRotMat() : matrix3x3
• SetVals() : OBFloatGrid
• SetValue() : OBPairData
• SetValues() : GasteigerState
• SetVector() : OBAtom
• SetVelocities() : OBConformerData
• SetVerbose() : OBScoreGrid
• SetVisitLock() : OBGraphBase
• SetWedge() : OBBond
• SetX() : vector3
• SetY() : vector3
• SetZ() : vector3
• Size() : OBRotor , OBRotorList , OBRing
• SkipObjects() : OBFormat
• Sleep() : DLHandler
• SmallestBondAngle() : OBAtom
• SortByIndex() : OBAngle
• SortRings() : OBRingSearch
• SpecificationURL() : OBFormat
• Sqrt() : OBSqrtTbl
• Start() : OBStopwatch
• start_kekulize() : OBMol
• StartErrorWrap() : OBMessageHandler
• StartLogging() : OBMessageHandler
• StopErrorWrap() : OBMessageHandler
• StopLogging() : OBMessageHandler
• StripSalts() : OBMol
• SwapEnds() : OBEdgeBase
• sync() : obLogBuf

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